Né à Osaka en 1979, Kenji Mori grandit dans la cuisine de son père, propriétaire d'un izakaya dans le quartier de Shinsekai. À quinze ans, il convainc sa mère de l'inscrire dans la brigade du restaurant kaiseki Kikunoi à Kyoto, sous la direction du maître Kunio Tokuoka. Il y passe sept ans à maîtriser les fondamentaux de la cuisine de saison japonaise : la lecture du produit, la maîtrise du couteau, la compréhension du feu.
En 2004, il rejoint Paris et entre chez Pierre Gagnaire rue Balzac. C'est là qu'il découvre la pensée scientifique appliquée à la cuisine, sous l'influence du physicien Hervé This qui collaborait alors avec Gagnaire. Deux ans plus tard, il est recruté comme chef de partie chez elBulli à Roses, en Catalogne. Il travaille aux côtés de Ferran Adrià pendant trois saisons consécutives, de 2006 à 2010, jusqu'à la fermeture du restaurant.
De retour à Tokyo en 2011, il ouvre un premier comptoir de dix couverts à Nakameguro qui reçoit une étoile Michelin en 2013. En 2018, il choisit Paris pour son projet le plus abouti : Umami Protocol, rue du Bac, dix-huit couverts, un seul menu, aucune carte.
2013
1 étoile Michelin — Tokyo, Nakameguro
2020
1 étoile Michelin — Paris, Umami Protocol
2022
2 étoiles Michelin — Paris, Umami Protocol
2024
OAD Top 50 Europe — #12